Soğanı yemeklik, sarımsakları incecik doğrayın. Patatesleri soyup kuşbaşı et formunda doğrayın. Kararmaması için suda bekletin.
Sıvıyağ, soğan ve sarımsağı geniş bir tavaya koyup orta ateşte 2-3 dakika kavurun.
İncecik halkalar halinde doğradığınız biberleri katıp 2 dakika daha kavurduktan sonra patatesleri ilave edin. 5 dakika pişirdikten sonra patatesin tam üzerine çıkacak kadar sıcak su ekleyin. Su kaynamaya başlayınca ocaktan alın. Tüm baharatları katıp karıştırın.
Yemeği orta boy cam bir fırın kabına aktarın.
Sosu için; yoğurt, karbonat, yumurta ve unu derin bir kasede çırpın. Sosu fırın kabındaki yemeğin üzerine gezdirin.
Musakkayı önceden ısıtıp 180 dereceye ayarladığınız fırında üzeri hafif kızarıncaya kadar, en az 30 dakika pişirip çıkarın.